Das BFE fördert subsidiär Forschungsprojekte, die den Schwerpunkten des aktuellen Energieforschungskonzepts des BFE 2021–2024 entsprechen. Im Vordergrund stehen anwendungsorientierte und entwicklungsnahe Forschungsprojekte. Es empfiehlt sich, vor der Einreichung des offiziellen Gesuchs mit der Forschungsprogrammleitung («BFE-Bereichs- und Programmleitende für die Energieforschung») Kontakt aufzunehmen.
Die Forschungsprogramme des BFE decken ein weites Spektrum der Energieforschung ab. In allen wesentlichen Technologiefeldern in den Bereichen erneuerbare Energien und Energieeffizienz führt das BFE spezifische Forschungsprogramme, die durch ein sozio-ökonomisches Querschnittsprogramm ergänzt werden.