L'UFE promuove anche progetti di ricerca incentrati sui temi cardine del Piano direttivo della ricerca energetica della Confederazione 2021 – 2024. Prioritari sono i progetti di ricerca applicata e di sviluppo. Si consiglia di prendere contatto con il responsabile dei programmi di ricerca («Interlocutori UFE») prima di presentare la richiesta ufficiale.
I programmi di ricerca dell'UFE coprono un ampio spettro della ricerca energetica. L'UFE gestisce programmi di ricerca specifici in tutti i settori tecnologici chiave delle energie rinnovabili e dell'efficienza energetica, completati da un programma trasversale socio-economico.