L’OFEN encourage subsidiairement des projets de recherche qui correspondent aux domaines prioritaires de l’actuel Plan directeur de la recherche énergétique 2021–2024. Les projets de recherche appliquée et de recherche en développement figurent au premier plan. Il est conseillé de prendre contact avec le responsable du programme de recherche au sein de l’OFEN («Responsables de domaine à l’OFEN») avant de soumettre une requête officielle.
Les programmes de recherche énergétique de l’OFEN couvrent tout l’éventail de la recherche énergétique. L’OFEN mène 24 programmes de recherche, dont une moitié porte sur l’efficacité énergétique et l’autre moitié sur les énergies renouvelables. Par ailleurs, quatre programmes de recherche sont consacrés à l’énergie nucléaire et un programme traite d’aspects socio-économiques.